История создания следственных подразделений в системе внутренних дел напрямую связана с созданием следственных органов в республике.
В годы, следующие за событиями октября 1917 года, на территории нынешнего Узбекистана в качестве следственных аппаратов были созданы многочисленные следственные комиссии. Комиссии по расследованию работали при советских и различных революционных трибуналах.
25 октября 1991 года МВД Узбекской ССР была преобразована в Министерство внутренних дел Республики Узбекистан, а Следственное управление было определено структурным подразделением министерства.
18 апреля 2017 года принято Постановление Президента Республики Узбекистан «О мерах по коренному совершенствованию деятельности органов внутренних дел в сфере расследования преступлений» № ПП-2898.
Эти реформы направлены на обеспечение уголовно-процессуальных норм гарантирующих того, чтобы каждый человек, совершивший преступление, был справедливо наказан и чтобы ни одно невиновное лицо не был привлечен к ответственности, своевременное раскрытие преступлений, полное и беспристрастное расследование, абсолютное соблюдение прав, свобод и законных интересов граждан, уважение их чести и достоинства в проведении расследования и досудебного расследования, обеспечение подлинной процессуальной независимости дознавателей и следователей, а также предотвращать незаконное влияние на них и необоснованное вмешательство в их деятельность.
Руководители Следственного департамента (Главного следственного управления, следственного управления):
1989-1992 гг. – Левочкин Павел Иванович;
1992-1993 гг. – Бурханов Кутбидин Нукритдинович;
1994-1997 гг. – Рахмонқулов Ахрор Худаярович;
1997-1998 гг. – Азизов Абдусалом Абдумавлянович;
1999-2005 гг. – Шарафутдинов Алишер Озодович;
2005-2006 гг. – Икрамов Шавкат Тахирович;
2006-2008 гг. – Шарофутдинов Алишер Озодович;
2008-2017 гг. – Нурматов Сайфулла Очилович;
2017-2019 гг. – Бобохонов Акрамхон Алохонович;
2019-2020 гг. – Ташходжаев Дониёр Бахтиярович;
2021-2024 гг. - Абдулхаков Яхёжон Артикбоевич;
2024-н.в - Ашропов Рамазон Ахматхужаевич.
